Proxectos de computación de malla con software libre contra COVID-19

Como moitos de vós xa sabedes, actualmente hai moitos en todo o mundo Proxectos de computación de malla, dos que algúns se basean Software libre e código aberto. E dos cales, moitos teñen fins científicos, especialmente médicos, como Folding @ home y Rosetta @ home.

Así, durante moito tempo, a maioría dos Proxectos de computación en rede, é dicir, aqueles que fan uso de recursos informáticos organizativos, públicos ou privados e o Proxectos de computación voluntaria, é dicir, os que fan uso de dispositivos de consumo masivo diarios, aproveitan o uso de aplicacións virtualizadas, paralelas e baseadas na GPU, principalmente en beneficio da humanidade.

Por exemplo e como referencia, podemos mencionar un coñecido Iniciativa Open Source Mesh Computing, da que publicamos hai máis de 6 meses, chamada BOINC, do que escribimos e paga a pena citar o seguinte:

"BOINC é un software creado, aloxado e patrocinado pola Universidade de California, Berkeley, desde 2002, con financiamento principalmente da Fundación Nacional de Ciencias dos Estados Unidos. Entón o teu sitio web oficial está aloxado no teu dominio. O que permitiu que o software, o seu código fonte, a súa documentación e desenvolvemento fosen accesibles a toda a comunidade interesada nun proxecto desta envergadura.".

"BOINC úsase en moitos proxectos de computación voluntarios, moitos dos cales están asociados a investigacións científicas, públicas e / ou privadas, principalmente realizadas por universidades e laboratorios de investigación. Proxectos aos que moitas veces calquera pode unirse para participar en calquera momento".

Proxectos de computación de malla

Folding @ home

Folding @ home é un Proxecto de computación de malla de código aberto centrado na investigación de enfermidades. Polo tanto, fai uso de recursos informáticos distribuídos para atoparlles as curas. A súa investigación céntrase no pregamento de proteínas. Este proxecto foi desenvolvido e está operado polo Laboratorio de Pande no Universidade de Stanford.

Xa que as proteínas montanse dobrándose sobre o corpo das células e, cando están mal plegadas, pode haber graves consecuencias para a saúde dunha persoa. En resumo, céntrase en simulación de pregamento de proteínas relevante para enfermidades e outras dinámicas moleculares.

Para iso, o proxecto ofrece un programa multiplataforma (Windows, MacOS e Linux)chamado FAH. No caso de sistemas operativos gratuítos e abertos, ofrece o programa a través de 3 ficheiros de instalación (en formato .deb e .rpm), e un fácil Guía de instalación para contribuír cos nosos recursos informáticos dispoñibles para unha contribución tan valiosa a favor da humanidade.

"FAH está construído a partir de varios instrumentos de código aberto, nomeadamente Gromacs (http://www.gromacs.org), TINKER (http://dasher.wustl.edu) e AMBER (http: // ambermd. Org /) para o Paquetes MD e MPICH para o MPI (http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/). Se estás interesado en consultar estes códigos, debes descargalos e comprobalos.". Páxina web oficial - sección Faq - Opensource

E por fin agora Folding @ home xuntouse para aportar a súa valiosa experiencia e coñecemento para contribuír a loita contra COVID.-19. E podes ver toda a túa contribución actual no teu sitio en GitHub.

Rosetta @ home

Rosetta @ home é un Proxecto de computación de malla de código aberto centrado na predición e / ou determinación de formas tridimensionais de proteínas, para axudar na investigación enfocada a lograr a curación dalgunhas das principais enfermidades humanas. Este proxecto forma parte do BOINC.

"Cremos que cada vez estamos máis preto de predicir e proxectar con precisión complexos e estruturas proteicas, un dos ósos santos da bioloxía informática. Pero para poder demostralo necesitamos unha inmensa cantidade de recursos informáticos, unha cantidade superior á que poden ofrecer os maiores supercomputadores do mundo. Isto só é posible a través dun esforzo conxunto de voluntarios coma ti.". Páxina web oficial - sección Que é Rosetta @ home?

Referíndose a loita contra COVID-19, Rosetta @ home xa se usou para axudar a predicir con precisión a estrutura a escala atómica dunha proteína importante no Coronavirus 19, semanas antes de poder medirse no laboratorio. Mentres que agora, o coñecemento adquirido ao estudar esta proteína viral estase a empregar agora para guiar a proteína deseño de novas vacinas e fármacos antivirais.

Para ver, obter, instalar e unirse a este valioso esforzo de BOINC y Rosetta @ home, pode acceder ás seguintes ligazóns: Código fonte y Guía de instalación e uso.

Conclusión

Agardamos isto "pequena publicación útil" sobre estes 2 proxectos «Computación en malla» creado para apoiar o traballo de creación de solucións contra as enfermidades e agora contra pandemia corrente de ano 2020, é dicir, o «Pandemia del COVID-19 (Coronavirus 19)», que son «Folding@home y Rosetta@home», ser de gran interese e utilidade para o conxunto «Comunidad de Software Libre y Código Abierto» e de gran contribución á difusión do marabilloso, xigantesco e crecente ecosistema de aplicacións de «GNU/Linux».

E para obter máis información, non dubide en visitar calquera Biblioteca en liña como OpenLibra y jedit Ler libros (PDF) sobre este tema ou outros áreas de coñecemento. De momento, se che gustou isto «publicación», non deixes de compartilo cos demais, no teu Sitios web, canles, grupos ou comunidades favoritos de redes sociais, preferentemente gratuítas e abertas como Mastodon, ou seguro como privado Telegrama.

Ou simplemente visite a nosa páxina de inicio en Desde Linux ou únete á canle oficial Telegrama de DesdeLinux para ler e votar esta ou outras publicacións interesantes en «Software Libre», «Código Abierto», «GNU/Linux» e outros temas relacionados co «Informática y la Computación», E «Actualidad tecnológica».