Isso mesmo. O Quantal terá apenas uma versão do Unity (a 3D). Essa ideia foi discutida na Cúpula de Desenvolvedores do Ubuntu em maio, mas foi confirmada em um relatório de bug no Launchpad.
Para aqueles cujas placas gráficas não são suficientemente potentes, será necessário usar o driver Mesa 3D LLVMpipe , que realiza os cálculos 3D na CPU. O Fedora utiliza esse mesmo driver com o GNOME Shell quando a aceleração gráfica não está disponível. De acordo com o site omgubuntu, isso ocorre porque o Unity 2D não conseguia oferecer todos os recursos da sua versão 3D, aumentando a preocupação dos desenvolvedores em relação à compatibilidade dos pacotes entre as duas versões.
Fontes:
http://www.h-online.com/open/news/item/Unity-2D-dropped-from-Ubuntu-12-10-Quantal-Quetzal-1669508.html
http://www.omgubuntu.co.uk/2012/08/unity-2d-removed-from-ubuntu-12-10