Projetos de Mesh Computing com Software Livre contra COVID-19

Como muitos de vocês já sabem, em todo o mundo existem atualmente muitos Projetos de computação em malha, dos quais alguns são baseados em Software Livre e Código Aberto. E dos quais, muitos têm fins científicos, principalmente médicos, como Folding @ home y Rosetta @ home.

Então, por um longo tempo, a maior parte do Projetos de computação em grade, ou seja, aqueles que fazem uso de recursos de computação organizacionais, públicos ou privados, e o Projetos de computação voluntária, ou seja, aqueles que fazem uso de dispositivos de consumo de massa do dia a dia, aproveitam o uso de aplicativos virtualizados, paralelos e baseados em GPU, principalmente em benefício da humanidade.

Por exemplo e como referência, podemos citar um conhecido Iniciativa de Mesh Computing de código aberto, da qual publicamos há mais de 6 meses, chamada BOINC, sobre o qual escrevemos e vale a pena citar o seguinte:

"O BOINC é um software criado, hospedado e patrocinado pela University of California, Berkeley, desde 2002, com financiamento principalmente da US National Science Foundation. Então seu Site oficial está hospedado em seu domínio. O que tem permitido que o software, seu código-fonte, sua documentação e desenvolvimento sejam acessíveis a toda a comunidade interessada em um projeto desta magnitude.".

"O BOINC é usado em muitos projetos de computação voluntários, muitos dos quais estão associados a pesquisas científicas, públicas e / ou privadas, principalmente realizadas por e em universidades e laboratórios de pesquisa. Projetos aos quais, muitas vezes, qualquer pessoa pode aderir para participar a qualquer momento".

Projetos de computação em malha

Folding @ home

Folding @ home é um Projeto de computação em malha de código aberto focado na pesquisa de doenças. Portanto, faz uso de recursos de computação distribuída para encontrar suas curas. Sua pesquisa se concentra no dobramento de proteínas. Este projeto foi desenvolvido e é operado pela Laboratório Pande na Universidade de Stanford.

Uma vez que as proteínas se montam dobrando-se sobre o corpo das células, e quando elas são dobradas incorretamente, pode haver sérias consequências para a saúde de uma pessoa. Em suma, ele se concentra em simulação de dobramento de proteína relevantes para doenças e outras dinâmicas moleculares.

Para tanto, o projeto oferece um programa de plataforma cruzada (Windows, MacOS e Linux)Chamado FAH. No caso de Sistemas Operacionais livres e abertos, oferece o programa por meio de 3 arquivos de instalação (nos formatos .deb e .rpm)e um fácil Guia de instalação para contribuir com nossos recursos de computação disponíveis para uma contribuição tão valiosa em favor da humanidade.

"FAH é construído a partir de vários instrumentos de código aberto, nomeadamente Gromacs (http://www.gromacs.org), TINKER (http://dasher.wustl.edu) e AMBER (http: // ambermd. org /) para os pacotes MD e MPICH para o MPI (http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/). Se você estiver interessado em verificar esses códigos, fique à vontade para baixá-los e verificá-los.". Site oficial - seção Faq - Open Source

E finalmente agora Folding @ home reuniu-se para trazer sua valiosa experiência e conhecimento para contribuir com a luta contra COVID.-19. E você pode ver todas as suas contribuições atuais, em seu site em GitHub.

Rosetta @ home

Rosetta @ home é um Projeto de computação em malha de código aberto focado na previsão e / ou determinação de formas tridimensionais de proteínas, para auxiliar em pesquisas voltadas para a cura de algumas das principais doenças humanas. Este projeto faz parte do BOINC.

"Acreditamos estar cada vez mais perto de prever e projetar complexos e estruturas de proteínas, um dos ossos sagrados da biologia da computação. Mas para demonstrar isso, precisamos de uma quantidade imensa de recursos de computação, uma quantidade maior do que os maiores supercomputadores do mundo podem oferecer. Isso só é possível por meio de um esforço conjunto de voluntários como você.". Site oficial - seção O que é Rosetta @ home?

Enquanto à luta contra COVID-19, Rosetta @ home já foi usado para ajudar a prever com precisão a estrutura em escala atômica de uma proteína importante no Coronavírus 19, semanas antes de poder ser medido em laboratório. Considerando que agora, o conhecimento adquirido com o estudo desta proteína viral agora está sendo usado para orientar o desenho de novas vacinas e medicamentos antivirais.

Para visualizar, obter, instalar e juntar-se a este valioso esforço de BOINC y Rosetta @ home, você pode acessar os seguintes links: Código fonte y Guia de instalação e uso.

Conclusão

Nós esperamos isso "postinho útil" sobre esses 2 projetos «Computación en malla» criado para apoiar o trabalho de criação de soluções contra doenças, e agora contra pandemia corrente de ano 2020, isto é, o «Pandemia del COVID-19 (Coronavirus 19)», os quais são «Folding@home y Rosetta@home», seja de grande interesse e utilidade, para todo o «Comunidad de Software Libre y Código Abierto» e de grande contribuição para a difusão do maravilhoso, gigantesco e crescente ecossistema de aplicações de «GNU/Linux».

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