Progetti di elaborazione mesh con software libero contro COVID-19

Come molti di voi già sanno, attualmente nel mondo ce ne sono molti Progetti di Mesh Computing, di cui alcuni sono basati su Software libero e open source. E di cui, molti hanno scopi scientifici, soprattutto medici, come Folding @ home y Rosetta @ home.

Quindi, per molto tempo, la maggior parte dei file Progetti di Grid Computing, cioè quelli che fanno uso di risorse informatiche organizzative, pubbliche o private e il Progetti di calcolo volontario, cioè quelli che fanno uso di dispositivi di consumo di massa di tutti i giorni, sfruttano l'uso di applicazioni virtualizzate, parallele e basate su GPU, principalmente in beneficio dell'umanità.

Ad esempio e come riferimento, possiamo citare un noto Iniziativa Open Source Mesh Computing, di cui abbiamo pubblicato più di 6 mesi fa, ha chiamato BOINC, di cui scriviamo e vale la pena citare quanto segue:

"BOINC è un software creato, ospitato e sponsorizzato dall'Università della California, Berkeley, dal 2002, con finanziamenti principalmente dalla US National Science Foundation. Quindi il tuo Sito ufficiale è ospitato nel tuo dominio. Ciò ha permesso che il software, il suo codice sorgente, la sua documentazione e il suo sviluppo fossero accessibili all'intera comunità interessata a un progetto di questa portata.".

"BOINC è utilizzato in molti progetti di calcolo volontario, molti dei quali associati a ricerche scientifiche, pubbliche e / o private, per lo più svolti da e in università e laboratori di ricerca. Progetti a cui, molte volte chiunque può aderire per partecipare in qualsiasi momento".

Progetti di Mesh Computing

Folding @ home

Folding @ home è un Progetto di elaborazione mesh open source incentrato sulla ricerca sulle malattie. Pertanto, fa uso di risorse informatiche distribuite per trovare le loro cure. La sua ricerca si concentra sul ripiegamento delle proteine. Questo progetto è stato sviluppato ed è gestito da Laboratorio Pande in Università di Stanford.

Poiché le proteine ​​si assemblano da sole piegandosi sul corpo delle cellule e quando vengono piegate in modo errato, possono esserci gravi conseguenze per la salute di una persona. Insomma, ci si concentra simulazione del ripiegamento delle proteine rilevanti per la malattia e altre dinamiche molecolari.

A tal fine, il progetto prevede un file programma multipiattaforma (Windows, MacOS e Linux), Chiamato FAH. Nel caso di sistemi operativi liberi e aperti, offre il programma tramite 3 file di installazione (in formato .deb e .rpm)e un facile Guida all'installazione per contribuire con le nostre risorse informatiche disponibili per un contributo così prezioso a favore dell'umanità.

"FAH è costruito da diversi strumenti open source, vale a dire Gromacs (http://www.gromacs.org), TINKER (http://dasher.wustl.edu) e AMBER (http: // ambermd. Org /) per il Pacchetti MD e MPICH per MPI (http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/). Se sei interessato a controllare questi codici, dovresti sentirti libero di scaricarli e controllarli.". Sito ufficiale - sezione Domande frequenti - Opensource

E finalmente adesso Folding @ home si è riunita per portare la sua preziosa esperienza e conoscenza a cui contribuire la lotta contro COVID.-19. E puoi vedere tutto il tuo contributo attuale, sul tuo sito all'indirizzo GitHub.

Rosetta @ home

Rosetta @ home è un Progetto di elaborazione mesh open source incentrato sulla previsione e / o determinazione di forme tridimensionali di proteine, per assistere nella ricerca focalizzata sul raggiungimento della cura di alcune delle principali malattie umane. Questo progetto fa parte di BOINC.

"Crediamo che ci stiamo avvicinando sempre di più alla previsione e alla progettazione accurata di complessi e strutture proteiche, una delle ossa sacre della biologia informatica. Ma per dimostrarlo, abbiamo bisogno di un'immensa quantità di risorse di calcolo, una quantità maggiore di quella che i più grandi supercomputer del mondo possono offrire. Questo è possibile solo grazie allo sforzo congiunto di volontari come te.". Sito ufficiale - sezione Che cosa è Rosetta @ home?

Riferendosi a lotta contro COVID-19, Rosetta @ home è già stato utilizzato per aiutare a prevedere con precisione la struttura su scala atomica di una proteina importante in CoronaVirus 19settimane prima che potesse essere misurato in laboratorio. Considerando che ora, la conoscenza acquisita dallo studio di questa proteina virale viene ora utilizzata per guidare il progettazione di nuovi vaccini e farmaci antivirali.

Per visualizzare, ottenere, installare e partecipare a questo prezioso sforzo di BOINC y Rosetta @ home, puoi accedere ai seguenti link: Codice sorgente y Guida all'installazione e all'uso.

Conclusione

Speriamo questo "piccolo post utile" su questi 2 progetti «Computación en malla» creato per supportare il lavoro di creazione di soluzioni contro le malattie e ora contro pandemia corrente di anno 2020, cioè il «Pandemia del COVID-19 (Coronavirus 19)», quali sono «Folding@home y Rosetta@home», è di grande interesse e utilità, per l'intero «Comunidad de Software Libre y Código Abierto» e di grande contributo alla diffusione del meraviglioso, gigantesco e crescente ecosistema di applicazioni di «GNU/Linux».

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